空间蛋白组学
透视感染与免疫博弈
感染性疾病的病理过程，本质是病原体与宿主免疫系统在组织微环境中的博弈。在感染组织中精准定位病原体、宿主免疫细胞与免疫应答信号，是理解感染机制的关键。
CODEX® 空间蛋白组学能够在单张切片同步标记病毒相关信号与数十种免疫标志物，揭示感染微环境的免疫学特征，为感染机制研究与治疗策略开发提供关键证据。
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空间蛋白组学透视感染与免疫的博弈 · 揭示感染性疾病微环境
感染性疾病的病理过程，本质是病原体与宿主免疫系统在组织微环境中的博弈。在感染组织中精准定位病原体、宿主免疫细胞与免疫应答信号，是理解感染机制的关键。
CODEX® 空间蛋白组学能够在单张切片同步标记病毒相关信号与数十种免疫标志物，揭示感染微环境的免疫学特征，为感染机制研究与治疗策略开发提供关键证据。
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基于空间组学揭示长新冠肺纤维化的免疫机制与新疗法
斯坦福大学团队 · 发表于 PNAS
长新冠肺纤维化组织的免疫微环境（多重免疫荧光 / CODEX 空间蛋白组学）
长新冠引起的肺纤维化可导致肺功能严重下降，甚至危及生命。斯坦福大学团队在 PNAS 发表研究，通过对患者肺组织的单细胞测序，发现 CD47、IL-6 和 JUN 等促炎及先天免疫相关基因显著上调，且与纤维化程度正相关；构建小鼠模型证实新冠后持续的免疫激活驱动纤维化进程。
研究者构建长新冠肺纤维化小鼠模型，联合应用组织原位检测（免疫组化、多重免疫荧光、CODEX 空间蛋白组学）、单细胞测序及质谱流式（CyTOF）等技术，系统解析纤维化组织的免疫微环境。
新冠后 21–103 天，天然免疫持续激活并伴随纤维化前程序；肺泡巨噬细胞大量减少，单核细胞被募集并分化为肺泡巨噬细胞。CODEX 空间蛋白组学（以 pJUN、CD47、IL-6 为标志）进一步证实，在胶原和波形蛋白富集区域存在持续的免疫激活与纤维化信号。
本研究整合 CODEX 空间蛋白组学、单细胞测序、CyTOF 与多重免疫荧光等多组学技术，系统描绘长新冠肺纤维化的免疫微环境图谱，并发现抗 IL-6/CD47 联合治疗可有效缓解纤维化、纠正免疫异常。研究表明 IL-6/JUN/CD47 信号轴与纤维化损伤密切相关，单药效果有限，而联合用药可显著减轻纤维化程度并纠正免疫异常，质谱流式分析进一步证实了上述变化，为人源化肺类器官模型中的抗纤维化效果提供佐证。空间蛋白组学不仅能标记新冠病毒及免疫细胞，更为临床干预提供了新思路。
为感染与免疫研究带来的关键能力
在组织原位同时标记病毒相关信号与宿主免疫细胞，明确感染灶的空间分布与边界。
多组学整合解析纤维化组织中天然免疫的持续激活与细胞组成变化，定位纤维化前程序。
揭示 IL-6/JUN/CD47 等信号轴与纤维化损伤的关系，指引抗 IL-6/CD47 联合治疗策略。
感染免疫 CODEX 空间蛋白组学研究出处